Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
UFM1P61960 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
UFM1P61960 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UFM1P61960 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UFM1P61960 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UFM1P61960 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UFM1P61960 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
UFM1P61960 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
UFM1P61960 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms