Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERVK-21P61565 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERVK-21P61565 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms