Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
LINC00313P59037 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms