Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
LINC01547P58512 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms