Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SNX16P57768 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX16P57768 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX16P57768 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX16P57768 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SNX16P57768 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms