Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RIPK4P57078 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms