Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NME5P56597 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NME5P56597 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NME5P56597 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NME5P56597 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms