Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HIRAP54198 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
HIRAP54198 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms