Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DAP3P51398 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DAP3P51398 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DAP3P51398 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DAP3P51398 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
DAP3P51398 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms