Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CCT3P49368 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CCT3P49368 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCT3P49368 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CCT3P49368 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCT3P49368 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCT3P49368 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms