Protein–RNA interactions for Protein: P36896

ACVR1B, Activin receptor type-1B, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1BP36896 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACVR1BP36896 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACVR1BP36896 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms