Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 PTP4A1-203ENST00000473334 638 ntTSL 324.97■■□□□ 1.593e-7■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-204ENST00000412471 917 ntTSL 531.87■■■□□ 2.692e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.072e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP4C-209ENST00000566749 1490 ntTSL 526.97■■□□□ 1.912e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-206ENST00000426119 676 ntTSL 326.94■■□□□ 1.92e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP4C-204ENST00000562664 941 ntTSL 326.92■■□□□ 1.92e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.852e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP4C-203ENST00000562222 742 ntTSL 326.48■■□□□ 1.832e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.792e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 HMGA2-207ENST00000537275 1508 ntTSL 1 (best)25.61■■□□□ 1.695e-12■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SPG7-217ENST00000568151 544 ntTSL 425.17■■□□□ 1.622e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 L3MBTL4-208ENST00000583809 549 ntTSL 424.65■■□□□ 1.542e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.495e-12■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP4C-205ENST00000563200 1447 ntTSL 524.25■■□□□ 1.472e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SPG7-214ENST00000566371 581 ntTSL 323.8■■□□□ 1.42e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.332e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP4C-207ENST00000563732 846 ntTSL 222.56■■□□□ 1.22e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 HMGA2-211ENST00000545998 1584 ntTSL 1 (best)22.04■■□□□ 1.125e-12■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.812e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 L3MBTL4-205ENST00000580162 457 ntTSL 319.53■□□□□ 0.722e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.682e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.62e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-208ENST00000430186 599 ntTSL 418.22■□□□□ 0.512e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 ZNF789-210ENST00000488485 1884 ntTSL 218.21■□□□□ 0.512e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.492e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 MGST2-203ENST00000503816 1780 ntTSL 517.67■□□□□ 0.422e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-207ENST00000428518 570 ntTSL 417.5■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.392e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 ZNF789-208ENST00000481472 411 ntTSL 417.19■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-205ENST00000414408 741 ntTSL 517.18■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 IGF1R-210ENST00000559925 2280 ntTSL 1 (best)17.18■□□□□ 0.342e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 ZNF789-203ENST00000447047 842 ntTSL 517.05■□□□□ 0.322e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.232e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-202ENST00000401463 732 ntTSL 315.91■□□□□ 0.142e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP6R3-225ENST00000534190 1980 ntTSL 215.73■□□□□ 0.112e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-210ENST00000442731 542 ntTSL 415.36■□□□□ 0.052e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PKM-214ENST00000565143 2301 ntTSL 1 (best)14.97□□□□□ -0.012e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 ZNF789-209ENST00000483089 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.062e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-217ENST00000488743 3174 ntTSL 214.48□□□□□ -0.092e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-201ENST00000310574 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.122e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 L3MBTL4-206ENST00000581231 568 ntTSL 513.99□□□□□ -0.172e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 TRIOBP-202ENST00000344404 7300 ntTSL 213.9□□□□□ -0.182e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-211ENST00000445802 871 ntTSL 513.68□□□□□ -0.222e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 AC092123.2-201ENST00000611189 5421 ntBASIC13.56□□□□□ -0.242e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 L3MBTL4-201ENST00000317931 3560 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.262e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 TRIOBP-204ENST00000406386 10129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.32e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 IGF1R-201ENST00000268035 11803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.392e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 IGF1R-204ENST00000558355 572 ntTSL 212.42□□□□□ -0.422e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PKM-205ENST00000561609 1568 ntTSL 1 (best)12.16□□□□□ -0.462e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SLC5A6-209ENST00000432106 725 ntTSL 311.63□□□□□ -0.552e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP6R3-214ENST00000527403 4862 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.612e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 L3MBTL4-202ENST00000400104 4534 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.622e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 IGF1R-203ENST00000557938 574 ntTSL 411.03□□□□□ -0.642e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 ZNF789-205ENST00000465438 4253 ntTSL 1 (best)11.01□□□□□ -0.652e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)10.86□□□□□ -0.672e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 ASXL1-204ENST00000470145 1073 ntTSL 510.51□□□□□ -0.732e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.842e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP6R3-210ENST00000526307 4134 ntTSL 28.73□□□□□ -1.012e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 MGST2-204ENST00000506797 634 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.22e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.252e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 MGST2-205ENST00000515067 437 ntTSL 36.7□□□□□ -1.342e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 PPP6R3-209ENST00000525421 830 ntTSL 54.85□□□□□ -1.632e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 CNTROB-204ENST00000570782 752 ntTSL 218.73■□□□□ 0.592e-7■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 CNTROB-212ENST00000576538 784 ntTSL 515.74■□□□□ 0.112e-7■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 CNTROB-202ENST00000563694 3705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.082e-7■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 CNTROB-201ENST00000380262 3769 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.122e-7■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 CNTROB-205ENST00000570784 695 ntTSL 313.21□□□□□ -0.292e-7■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.321e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.111e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.171e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.031e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-210ENST00000425265 866 ntTSL 321.49■■□□□ 1.031e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-218ENST00000528831 463 ntTSL 319.61■□□□□ 0.731e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-217ENST00000527563 579 ntTSL 319.21■□□□□ 0.671e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SCAF1-204ENST00000601038 491 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.2■□□□□ 0.661e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.511e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.371e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 AL603832.3-205ENST00000606954 680 ntTSL 216.79■□□□□ 0.281e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-212ENST00000468093 1042 ntTSL 316.37■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-219ENST00000534717 574 ntTSL 316.36■□□□□ 0.211e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-216ENST00000484280 891 ntTSL 515.41■□□□□ 0.061e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SCAF1-202ENST00000595242 463 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.86□□□□□ -0.031e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.041e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.041e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-215ENST00000484054 521 ntTSL 514.79□□□□□ -0.041e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-214ENST00000478447 420 ntTSL 214.31□□□□□ -0.121e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-209ENST00000414971 470 ntTSL 314.05□□□□□ -0.161e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 AL603832.3-202ENST00000607158 807 ntTSL 513.77□□□□□ -0.211e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 AL603832.3-203ENST00000606505 813 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 AL603832.3-204ENST00000605933 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.99□□□□□ -0.331e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 AL603832.3-201ENST00000471038 792 ntTSL 212.26□□□□□ -0.451e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RHOC-211ENST00000436685 517 ntTSL 511.79□□□□□ -0.521e-6■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 SIRT5-205ENST00000606117 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.593e-9■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 COMT-208ENST00000428707 724 ntTSL 315.06■□□□□ 06e-10■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.825e-9■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.485e-9■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RBM14-207ENST00000461478 693 ntTSL 223.41■■□□□ 1.342e-12■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RBM14-206ENST00000460762 459 ntTSL 222.63■■□□□ 1.212e-12■■□□□ 13.3
GTF2F1P35269 RBM14-209ENST00000512283 567 ntTSL 420.43■□□□□ 0.862e-12■■□□□ 13.3
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 96.5 ms