Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
GABRA5P31644 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
GABRA5P31644 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms