Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
HOXA9P31269 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms