Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CRABP1P29762 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CRABP1P29762 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms