Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ITGA3P26006 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ITGA3P26006 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms