Protein–RNA interactions for Protein: P23025

XPA, DNA repair protein complementing XP-A cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPAP23025 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
XPAP23025 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
XPAP23025 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
XPAP23025 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
XPAP23025 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
XPAP23025 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
XPAP23025 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
XPAP23025 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms