Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
FGFR3P22607 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
FGFR3P22607 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms