Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
EFNA1P20827 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms