Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATF3P18847 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF3P18847 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATF3P18847 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF3P18847 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF3P18847 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF3P18847 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF3P18847 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF3P18847 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF3P18847 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATF3P18847 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATF3P18847 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms