Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ESRRAP11474 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms