Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ITGAMP11215 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms