Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RARBP10826 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RARBP10826 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RARBP10826 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RARBP10826 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RARBP10826 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RARBP10826 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RARBP10826 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RARBP10826 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RARBP10826 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RARBP10826 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RARBP10826 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms