Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SMIM10L2BP0DMW5 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms