Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C8orf89P0DMQ9 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C8orf89P0DMQ9 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms