Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
HLA-DQB1P01920 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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