Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CLDN9O95484 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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