Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TRMUO75648 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TRMUO75648 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms