Protein–RNA interactions for Protein: O60296

TRAK2, Trafficking kinesin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAK2O60296 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAK2O60296 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms