Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
HOXA3O43365 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
HOXA3O43365 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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