Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
FANCAO15360 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FANCAO15360 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FANCAO15360 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
FANCAO15360 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FANCAO15360 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FANCAO15360 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FANCAO15360 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FANCAO15360 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FANCAO15360 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms