Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BCKDKO14874 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms