Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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CTDSP2O14595 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CTDSP2O14595 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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