Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NPIPB9F8W1W9 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms