Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 KCNG4-201ENST00000308251 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LINC00587B1AMM8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms