Protein–RNA interactions for Protein: B1AKI9

ISM1, Isthmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISM1B1AKI9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ISM1B1AKI9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms