Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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C4orf47A7E2U8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C4orf47A7E2U8 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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