Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GOLGA6L9A6NEM1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms