Protein–RNA interactions for Protein: A2RUR9

CCDC144A, Coiled-coil domain-containing protein 144A, humanhuman

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC144AA2RUR9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCDC144AA2RUR9 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCDC144AA2RUR9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms