Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
LINC00312Q9Y6C7 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
LINC00312Q9Y6C7 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms