Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
COPS3Q9UNS2 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
COPS3Q9UNS2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms