Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NKX1-2Q9UD57 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms