Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SPASTQ9UBP0 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SPASTQ9UBP0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms