Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CNTN3Q9P232 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms