Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L0

VAPA, Vesicle-associated membrane protein-associated protein A, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPAQ9P0L0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VAPAQ9P0L0 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms