Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J0

NDUFA13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA13Q9P0J0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFA13Q9P0J0 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms