Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBW1

LRRC4, Leucine-rich repeat-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC4Q9HBW1 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LRRC4Q9HBW1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms