Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCSER1Q9C0I3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
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