Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ROPN1BQ9BZX4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ROPN1BQ9BZX4 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms