Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
YTHDF1Q9BYJ9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
YTHDF1Q9BYJ9 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms